RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PNMA2Q9UL42 364 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 RGS2P41220 211 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 NEK4P51957 841 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 USH1GQ495M9 461 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 TNS4Q8IZW8 715 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 APBA2Q99767 749 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ADCY3O60266 1144 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 COBLO75128 1261 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ELNP15502 786 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 AK2P54819 239 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 MCM3APO60318 1980 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 NFIBO00712 420 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PGK2P07205 417 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 FUT2Q10981 343 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP2R5BQ15173 497 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXO11Q86XK2 927 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 GRK4P32298 578 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 DPP9Q86TI2 863 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 AMNQ9BXJ7 453 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 CCL14Q16627 93 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIB2Q92519 343 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCB11O95342 1321 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD1Q15327 319 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 ARMC5Q96C12 935 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX11Q96FC9 970 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.2■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 NSMFQ6X4W1 530 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 ABHD8Q96I13 439 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 PFASO15067 1338 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 IGHA2P01877 340 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 NTRK3Q16288 839 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 OPLAHO14841 1288 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 HMGCRP04035 888 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 MAML3Q96JK9 1138 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF333Q96JL9 665 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 STK3Q13188 491 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 FGD4Q96M96 766 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 INHAP05111 366 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 CNTN2Q02246 1040 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM32Q13049 653 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.16■■□□□ 1.62
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SLC25A39-201ENST00000225308 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 ASTN1O14525 1302 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 POTEB2H3BUK9 544 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 LARGE1O95461 756 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAF1Q13077 416 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D5Q92609 795 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 PHKBQ93100 1093 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC25A39-201ENST00000225308 PFKFB2O60825 505 aa25.14■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 IFNAR1P17181 557 aa25.14■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 SCRN1Q12765 414 aa25.14■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 ME3Q16798 604 aa25.14■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 PPFIA3O75145 1194 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP2C19P33261 490 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 GHRHRQ02643 423 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC25A39-201ENST00000225308 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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