RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000037974.9

Ptprm-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprm, Length 5,186 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Sumf1Q8R0F3 372 aa11.17□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Clic4Q9QYB1 253 aa11.17□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Apol7aB2RT54 418 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Dnajb6O54946 365 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Gse1Q3U3C9 1213 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 FcgrtQ61559 365 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Scfd2Q8BTY8 684 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Capn12Q9ER56 720 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Gimd1E9PW74 217 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Hoxd10P28359 340 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 CtshP49935 333 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Apba2P98084 750 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Gbp1Q01514 589 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Samhd1Q60710 627 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Jade3Q6IE82 823 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 GypcQ78HU7 95 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Aggf1Q7TN31 711 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Akap7Q7TN79 314 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Ppm1mQ8BU27 406 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Lrit1Q8K099 624 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Pus3Q9JI38 481 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Akt3Q9WUA6 479 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Adamts18Q4VC17 1219 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Abi1Q8CBW3 481 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Znf467Q8JZL0 594 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Psmd2Q8VDM4 908 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Pidd1Q9ERV7 915 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Tmem47Q9JJG6 181 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Cnpy2Q9QXT0 182 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Slit3Q9WVB4 1523 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Eepd1Q3TGW2 569 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Syne3Q4FZC9 975 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Trim37Q6PCX9 961 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Morc2bQ8C5W4 1022 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Bcs1lQ9CZP5 418 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 CenpkQ9ESN5 271 aa11.16□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Ccdc25Q78PG9 208 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 RragaQ80X95 313 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Apol10aQ8CCA5 318 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Yipf1Q91VU1 306 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Sdr42e1Q9D665 394 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 TxkP42682 527 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Rps12P63323 132 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Ccdc125Q5U465 500 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Rsad2Q8CBB9 362 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 StamP70297 548 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Stxbp2Q64324 593 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Pcdha12Q91Y18 950 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Gbp7Q91Z40 638 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Sh2b1Q91ZM2 756 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Snrnp35Q9D384 244 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Rbp7Q9EPC5 134 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Arl6ip4Q9JM93 229 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Trpc5Q9QX29 975 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Sik3Q6P4S6 1311 aa11.15□□□□□ -0.62
Ptprm-201ENSMUST00000037974 C87977A2A958 498 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Mmp14P53690 582 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Cacnb3P54285 484 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Mtus1Q5HZI1 1210 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Hdac4Q6NZM9 1076 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Syne4Q8CII8 388 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 CutaQ9CQ89 177 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Polr3eQ9CZT4 710 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Slc5a4aQ9ET37 656 aa11.15□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Usp32F8VPZ3 1604 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Rsad1Q5SUV1 442 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Dzip3Q7TPV2 1204 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Alx1Q8C8B0 326 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Arfgap2Q99K28 520 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 IydQ9DCX8 285 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Znf541Q0GGX2 1363 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Pnma5Q5DTT8 618 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Cdc37Q61081 379 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Atg9aQ68FE2 551 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Skor1Q8BX46 964 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Dppa3Q8QZY3 150 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Cps1Q8C196 1500 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Nrxn1Q9CS84 1514 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Mmrn2A6H6E2 943 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Serpinb8O08800 374 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Q3UJP5 209 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Ints8Q80V86 995 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 RalylQ8BTF8 293 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Tmod3Q9JHJ0 352 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Tulp1Q9Z273 543 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Pfkfb3A7UAK5 555 aa11.14□□□□□ -0.63
Ptprm-201ENSMUST00000037974 Rbm46P86049 533 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.2 ms