RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P RIM11P38615 370 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR020WP38708 688 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P INM1P38710 295 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR045WP38775 560 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GIC1P38785 314 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR127WP38833 243 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P SPF1P39986 1215 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HOS4P40480 1083 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ELP2P42935 788 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GAT1P43574 510 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GCV1P48015 400 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL260WP53056 76 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CLD1P53264 445 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HST2P53686 357 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HOS3Q02959 697 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BLS1Q06071 122 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NUT2Q06213 157 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SYT1Q06836 1226 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR114WQ12219 294 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MCM16Q12262 181 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RGT2Q12300 763 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MDM35O60200 86 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P COX6P00427 148 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL17AP05740 184 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GAL7P08431 366 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YAR066WP0CX18 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR214WP0CX19 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P LAT1P12695 482 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P URA4P20051 364 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CLN2P20438 545 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P AMS1P22855 1083 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YCK2P23292 546 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MLS1P30952 554 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ZIP1P31111 875 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PTM1P32857 523 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P UBC6P33296 250 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SKT5P34226 696 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF14P35189 244 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P LRG1P35688 1017 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ASK1P35734 292 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPL37P36532 105 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P APT2P36973 181 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YSW1P38280 609 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CCT4P39078 528 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ALA1P40825 983 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TFG1P41895 735 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YRB1P41920 201 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YFR020WP43600 232 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL17BP46990 184 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL049WP47048 450 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CCT8P47079 568 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TIS11P47977 285 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P COS12P53053 380 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BOL2P53082 120 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P KXD1P53158 218 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ADE12P80210 433 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GOT1Q03554 138 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CSN9Q03981 162 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P DFG5Q05031 458 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC123Q05791 360 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GIC2Q06648 383 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YET3Q07451 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR030WQ07967 263 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MCA1Q08601 432 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL272CQ08984 517 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HAL9Q12180 1030 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL107WQ12239 342 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ICT1Q12385 394 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P LAG2Q92325 660 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SRN2Q99176 213 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PNO1Q99216 274 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CSF1Q12150 2958 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC9P04819 755 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YML002WP0CF17 737 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P FUR1P18562 216 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MRPL32P25348 183 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P LDB16P25587 256 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BUB3P26449 341 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC12P32468 407 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PTH2P34222 208 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SEF1P34228 1148 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YPT52P36018 234 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MMS21P38632 267 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P UBA4P38820 440 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MTG2P38860 518 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MNL1P38888 796 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BEM4P39011 633 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MBP1P39678 833 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PTC2P39966 464 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HAT2P39984 401 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms