RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M RIM11P38615 370 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR020WP38708 688 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M INM1P38710 295 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR045WP38775 560 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GIC1P38785 314 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR127WP38833 243 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M SPF1P39986 1215 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HOS4P40480 1083 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ELP2P42935 788 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GAT1P43574 510 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GCV1P48015 400 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL260WP53056 76 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CLD1P53264 445 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HST2P53686 357 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HOS3Q02959 697 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BLS1Q06071 122 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NUT2Q06213 157 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SYT1Q06836 1226 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR114WQ12219 294 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MCM16Q12262 181 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RGT2Q12300 763 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MDM35O60200 86 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M COX6P00427 148 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL17AP05740 184 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GAL7P08431 366 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YAR066WP0CX18 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR214WP0CX19 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M LAT1P12695 482 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M URA4P20051 364 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CLN2P20438 545 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M AMS1P22855 1083 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YCK2P23292 546 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MLS1P30952 554 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ZIP1P31111 875 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PTM1P32857 523 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M UBC6P33296 250 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SKT5P34226 696 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TAF14P35189 244 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M LRG1P35688 1017 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ASK1P35734 292 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL37P36532 105 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M APT2P36973 181 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YSW1P38280 609 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CCT4P39078 528 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ALA1P40825 983 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TFG1P41895 735 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YRB1P41920 201 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YFR020WP43600 232 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL17BP46990 184 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL049WP47048 450 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CCT8P47079 568 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TIS11P47977 285 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M COS12P53053 380 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BOL2P53082 120 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M KXD1P53158 218 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ADE12P80210 433 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GOT1Q03554 138 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CSN9Q03981 162 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M DFG5Q05031 458 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC123Q05791 360 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GIC2Q06648 383 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YET3Q07451 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR030WQ07967 263 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MCA1Q08601 432 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL272CQ08984 517 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HAL9Q12180 1030 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL107WQ12239 342 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ICT1Q12385 394 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M LAG2Q92325 660 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SRN2Q99176 213 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PNO1Q99216 274 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CSF1Q12150 2958 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC9P04819 755 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YML002WP0CF17 737 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M FUR1P18562 216 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL32P25348 183 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M LDB16P25587 256 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BUB3P26449 341 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC12P32468 407 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PTH2P34222 208 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SEF1P34228 1148 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YPT52P36018 234 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MMS21P38632 267 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M UBA4P38820 440 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MTG2P38860 518 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MNL1P38888 796 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BEM4P39011 633 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MBP1P39678 833 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PTC2P39966 464 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HAT2P39984 401 aa2.54□□□□□ -2
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