RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K RIM11P38615 370 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR020WP38708 688 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K INM1P38710 295 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR045WP38775 560 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GIC1P38785 314 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR127WP38833 243 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K SPF1P39986 1215 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HOS4P40480 1083 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ELP2P42935 788 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GAT1P43574 510 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GCV1P48015 400 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL260WP53056 76 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CLD1P53264 445 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HST2P53686 357 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HOS3Q02959 697 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BLS1Q06071 122 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NUT2Q06213 157 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SYT1Q06836 1226 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR114WQ12219 294 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MCM16Q12262 181 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RGT2Q12300 763 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MDM35O60200 86 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K COX6P00427 148 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL17AP05740 184 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GAL7P08431 366 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YAR066WP0CX18 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR214WP0CX19 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K LAT1P12695 482 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K URA4P20051 364 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CLN2P20438 545 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K AMS1P22855 1083 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YCK2P23292 546 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MLS1P30952 554 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ZIP1P31111 875 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PTM1P32857 523 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K UBC6P33296 250 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SKT5P34226 696 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TAF14P35189 244 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K LRG1P35688 1017 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ASK1P35734 292 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL37P36532 105 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K APT2P36973 181 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YSW1P38280 609 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CCT4P39078 528 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ALA1P40825 983 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TFG1P41895 735 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YRB1P41920 201 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YFR020WP43600 232 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL17BP46990 184 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL049WP47048 450 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CCT8P47079 568 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TIS11P47977 285 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K COS12P53053 380 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BOL2P53082 120 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K KXD1P53158 218 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ADE12P80210 433 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GOT1Q03554 138 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CSN9Q03981 162 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K DFG5Q05031 458 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC123Q05791 360 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GIC2Q06648 383 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YET3Q07451 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR030WQ07967 263 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MCA1Q08601 432 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL272CQ08984 517 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HAL9Q12180 1030 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL107WQ12239 342 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ICT1Q12385 394 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K LAG2Q92325 660 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SRN2Q99176 213 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PNO1Q99216 274 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CSF1Q12150 2958 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC9P04819 755 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YML002WP0CF17 737 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K FUR1P18562 216 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL32P25348 183 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K LDB16P25587 256 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BUB3P26449 341 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC12P32468 407 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PTH2P34222 208 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SEF1P34228 1148 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YPT52P36018 234 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MMS21P38632 267 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K UBA4P38820 440 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MTG2P38860 518 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MNL1P38888 796 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BEM4P39011 633 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MBP1P39678 833 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PTC2P39966 464 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HAT2P39984 401 aa2.54□□□□□ -2
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