RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM11P38615 370 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR020WP38708 688 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J INM1P38710 295 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR045WP38775 560 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GIC1P38785 314 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR127WP38833 243 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J SPF1P39986 1215 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HOS4P40480 1083 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ELP2P42935 788 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GAT1P43574 510 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GCV1P48015 400 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL260WP53056 76 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CLD1P53264 445 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HST2P53686 357 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HOS3Q02959 697 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BLS1Q06071 122 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NUT2Q06213 157 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SYT1Q06836 1226 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR114WQ12219 294 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM16Q12262 181 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RGT2Q12300 763 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM35O60200 86 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J COX6P00427 148 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL17AP05740 184 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GAL7P08431 366 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YAR066WP0CX18 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR214WP0CX19 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J LAT1P12695 482 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J URA4P20051 364 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CLN2P20438 545 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J AMS1P22855 1083 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YCK2P23292 546 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MLS1P30952 554 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ZIP1P31111 875 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PTM1P32857 523 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J UBC6P33296 250 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SKT5P34226 696 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF14P35189 244 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J LRG1P35688 1017 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ASK1P35734 292 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL37P36532 105 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J APT2P36973 181 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YSW1P38280 609 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CCT4P39078 528 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ALA1P40825 983 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TFG1P41895 735 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YRB1P41920 201 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YFR020WP43600 232 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL17BP46990 184 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL049WP47048 450 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CCT8P47079 568 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TIS11P47977 285 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J COS12P53053 380 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BOL2P53082 120 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J KXD1P53158 218 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ADE12P80210 433 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GOT1Q03554 138 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CSN9Q03981 162 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J DFG5Q05031 458 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC123Q05791 360 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GIC2Q06648 383 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YET3Q07451 203 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR030WQ07967 263 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MCA1Q08601 432 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL272CQ08984 517 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HAL9Q12180 1030 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL107WQ12239 342 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ICT1Q12385 394 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J LAG2Q92325 660 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SRN2Q99176 213 aa2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PNO1Q99216 274 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CSF1Q12150 2958 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC9P04819 755 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YML002WP0CF17 737 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J FUR1P18562 216 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL32P25348 183 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J LDB16P25587 256 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BUB3P26449 341 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC12P32468 407 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PTH2P34222 208 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SEF1P34228 1148 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPT52P36018 234 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MMS21P38632 267 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J UBA4P38820 440 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MTG2P38860 518 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MNL1P38888 796 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BEM4P39011 633 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MBP1P39678 833 aa2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PTC2P39966 464 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HAT2P39984 401 aa2.54□□□□□ -2
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