RNA–Protein interactions for RNA: YOR242C

SSP2, Transcript of Sporulation specific protein that localizes to the spore wall, yeast

Gene SSP2, Length 1,116 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP2	YOR242C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	SYN8	P31377	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	MIC60	P36112	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YJL070C	P40361	888 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	LCL3	P53153	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	OPY2	Q06810	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	KAR3	P17119	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	POL4	P25615	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	CHS3	P29465	1165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	ACH1	P32316	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	SPC34	P36131	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	AFG3	P39925	761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	AXL1	P40851	1208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	GUF1	P46943	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YML037C	Q03703	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	MSS11	Q03825	758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	DIC1	Q06143	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	SSK1	Q07084	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	DAP1	Q12091	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	CDC16	P09798	840 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YCK1	P23291	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YJL068C	P40363	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	DUG3	P53871	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	CRZ1	P53968	678 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	RBA50	Q04418	439 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	SNC1	P31109	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	PTR3	P43606	678 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	EFM6	P53970	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	SPE4	Q12455	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP2	YOR242C	PHO2	P07269	559 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	PMS1	P14242	873 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	TYR1	P20049	452 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	IMG1	P25626	169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	RGT1	P32862	1170 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YKL100C	P34248	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YBL029W	P38201	376 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	LAG1	P38703	411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	VID27	P40157	782 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YKU80	Q04437	629 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	UBP11	P36026	717 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	NUP133	P36161	1157 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	NGL3	Q03210	505 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	ARP6	Q12509	438 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	SGS1	P35187	1447 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YIH1	P25637	258 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	ICS2	P38284	255 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	MRS3	P10566	314 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	BOS1	P25385	244 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	FAR3	P46671	204 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YGR127W	P53275	312 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	MSC1	Q03104	513 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	RTT103	Q05543	409 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	HUA2	Q12134	243 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	SEC62	P21825	274 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	SNG1	P46950	547 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	IKS1	P47042	667 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	BUD32	P53323	261 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YEH2	Q07950	538 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	SGF29	P25554	259 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	PAH1	P32567	862 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	YBR144C	P34215	104 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SSP2	YOR242C	ECM15	P35195	104 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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