RNA–Protein interactions for RNA: YOL053W

AIM39, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene AIM39, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM39	YOL053W	IRC7	P43623	340 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YTP1	P53584	459 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RMT2	Q03305	412 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	REC107	P21651	314 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	SEC66	P33754	206 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	MSR1	P38714	643 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	SGF73	P53165	657 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ATP23	P53722	227 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ASI1	P54074	624 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	CDC45	Q08032	650 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ARG81	P05085	880 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YCR051W	P25631	222 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	SWI3	P32591	825 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YME1	P32795	747 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YKL100C	P34248	587 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	GCS1	P35197	352 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	MIA40	P36046	403 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	STB6	P36085	766 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	STB2	P46679	850 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	UBP8	P50102	471 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RSM23	Q01163	450 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	MSC1	Q03104	513 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	SWF1	Q04629	336 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	FRE3	Q08905	711 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	FLO10	P36170	1169 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ARP1	P38696	384 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	VPS41	P38959	992 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	CIN4	P39110	191 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RCF1	Q03713	159 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	VTA1	Q06263	330 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	IRC3	Q06683	689 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	OSW1	Q08692	278 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	BNR1	P40450	1375 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	PUT2	P07275	575 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	PMS1	P14242	873 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	CLC1	P17891	233 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	NUP1	P20676	1076 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	NMD5	P46970	1048 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ERO1	Q03103	563 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	COQ9	Q05779	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ORM2	Q06144	216 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	PFA4	Q12006	378 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	CLB1	P24868	471 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ELO2	P25358	347 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	GAC1	P28006	793 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	VPS9	P54787	451 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	CIK1	Q01649	594 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	TOF2	Q02208	771 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ROY1	Q04847	553 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	FRE7	Q12333	620 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ISN1	Q99312	450 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ERG11	P10614	530 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	BUD14	P27637	709 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	COQ3	P27680	312 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	UBA4	P38820	440 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	YIL060W	P40519	144 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	ZIM17	P42844	174 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	AIM32	Q04689	311 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AIM39	YOL053W	RRI1	Q12468	440 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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