RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C UAF30Q08747 228 aa3.39□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SWT1Q12104 458 aa3.39□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C HOM2P13663 365 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C APN1P22936 367 aa3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C HXT3P32466 567 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C UGP1P32861 499 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C VPS17P32913 551 aa3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C KES1P35844 434 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C ARO9P38840 513 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C MIT1P40002 666 aa3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C CUE3P53137 624 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C TOF2Q02208 771 aa3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YLH47Q06493 454 aa3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C RLM1Q12224 676 aa3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C HIR3P47171 1648 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YBR085C-AO43137 85 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SRB5P32585 307 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C WBP1P33767 430 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C ELF1P36053 145 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C CMC1P36064 111 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YHR131CP38835 850 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C AFG3P39925 761 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C AGX1P43567 385 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C ASN1P49089 572 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C KAP120Q02932 1032 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YDR179W-AQ03983 463 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C HER1Q12276 1246 aa3.37□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C MDM10P18409 493 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C GRR1P24814 1151 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C LRE1P25579 583 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YIH1P25637 258 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C RML2P32611 393 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C LTV1P34078 463 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SLM4P38247 162 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C HXT14P42833 540 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SWP82P43554 623 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YGR079WP53249 370 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C RBA50Q04418 439 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C DCI1Q08558 271 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C UBX3Q12229 455 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C AVL9Q12500 764 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C MRP13P12686 339 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C PPH22P23595 377 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YSP3P25036 478 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C MRE11P32829 692 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C PXL1P36166 706 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C MRPL7P36519 292 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C CHS6P40955 746 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SNM1P40993 198 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C RPN14P53196 417 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C TWF1P53250 332 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C FMP30Q02883 468 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C OSW1Q08692 278 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C ULA1Q12059 462 aa3.36□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YML133CQ03099 1374 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YLL067CQ07888 1374 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YLL066CQ99208 1374 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C CRM1P30822 1084 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YMC1P32331 307 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SPC110P32380 944 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YME2P32843 850 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SEC66P33754 206 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YDR089WP38966 869 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C PKP1P40530 394 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SMC3P47037 1230 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C IRC8P47046 822 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C FMS1P50264 508 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SHE10P53075 577 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C STR3P53101 465 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C YGR266WP53326 701 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C IPI3P53877 555 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C INA17Q02888 182 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SEG1Q04279 960 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C SIL1Q08199 421 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C APC5Q08683 685 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C APL5Q08951 932 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C AFT2Q08957 416 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C VPS54Q12071 889 aa3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C HIP1P06775 603 aa3.34□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C PDA1P16387 420 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C STE4P18851 423 aa3.34□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
HRD1YOL013C PHO91P27514 894 aa3.34□□□□□ -1.87
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