RNA–Protein interactions for RNA: YMR028W

TAP42, Transcript of Essential protein involved in the TOR signaling pathway, yeast

Gene TAP42, Length 1,101 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAP42	YMR028W	SRB5	P32585	307 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	MSN2	P33748	704 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SMC3	P47037	1230 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	THI20	Q08224	551 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	ERG8	P24521	451 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SPR1	P32603	445 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	VPS17	P32913	551 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	CNS1	P33313	385 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SLC1	P33333	303 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TFC3	P34111	1160 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	UBA4	P38820	440 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	RIC1	P40395	1056 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SAM50	P53969	484 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	REG1	Q00816	1014 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	YML131W	Q03102	365 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	VCX1	Q99385	411 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	YLR302C	O13544	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	HEM2	P05373	342 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SNC1	P31109	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	ECM15	P35195	104 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	ESL2	P36168	1195 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	AXL2	P38928	823 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	PSD1	P39006	500 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	PKP1	P40530	394 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	VPS4	P52917	437 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	NNF2	P53253	936 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	MHR1	Q06630	226 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	YER010C	P40011	234 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	YNR061C	P53747	219 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	PSK2	Q08217	1101 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	NUS1	Q12063	375 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	YOR019W	Q99248	730 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SEC62	P21825	274 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	DPB3	P27344	201 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	CDC15	P27636	974 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	RRN3	P36070	627 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	RCO1	Q04779	684 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SNO4	Q04902	237 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	HNT3	Q08702	217 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	HSP32	Q08992	237 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	MRP20	P32387	263 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	IME4	P41833	600 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	YMR087W	Q04299	284 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SSK1	Q07084	712 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SSP2	Q08646	371 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	ATR1	P13090	542 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	PGS1	P25578	521 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	CBF2	P32504	956 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	CBK1	P53894	756 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	YLR152C	P54072	576 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	MUB1	Q03162	620 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	RER1	P25560	188 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	TUL1	P36096	758 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	ALY1	P36117	915 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	FMP10	P40098	244 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SLZ1	P40167	298 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	INN1	P53901	409 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	APL4	Q12028	832 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	ATG9	Q12142	997 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	NBP2	Q12163	236 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TAP42	YMR028W	SNF3	P10870	884 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	YME1	P32795	747 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	PMU1	P36069	295 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	TIS11	P47977	285 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	DIC1	Q06143	298 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	YIM1	P28625	365 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	SSH4	P32343	579 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TAP42	YMR028W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93

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