RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	ICS2	P38284	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ARP1	P38696	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	HXT14	P42833	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	IRC7	P43623	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YTP1	P53584	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	IPI3	P53877	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	MSC1	Q03104	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SGS1	P35187	1447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	APN1	P22936	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	BUD14	P27637	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	PMT1	P33775	817 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SAS3	P34218	831 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YKL100C	P34248	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	VPS41	P38959	992 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	CIN4	P39110	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	LTP1	P40347	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	VPS9	P54787	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RCF1	Q03713	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	OSW1	Q08692	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ARG81	P05085	880 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	PUT2	P07275	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	NUP1	P20676	1076 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	REC107	P21651	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	PPZ2	P33329	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	MSR1	P38714	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	STB2	P46679	850 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	UBP8	P50102	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ATP23	P53722	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	VTA1	Q06263	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	CDC45	Q08032	650 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ISA2	Q12425	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	PMS1	P14242	873 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	MBR1	P23493	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SNT1	P25357	1226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YCR051W	P25631	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	FLO10	P36170	1169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SSU1	P41930	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	NMD5	P46970	1048 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SGF73	P53165	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	CIK1	Q01649	594 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	BNR1	P40450	1375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ELO2	P25358	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	COQ3	P27680	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SWI3	P32591	825 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YME1	P32795	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	GCS1	P35197	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	STB6	P36085	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	UBA4	P38820	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RSM23	Q01163	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	VTC3	Q02725	835 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	CAC2	Q04199	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	TAP42	Q04372	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ORM2	Q06144	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	FRE3	Q08905	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ISN1	Q99312	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	CLB1	P24868	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	ANS1	P38832	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	YNL144C	P53907	740 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	TOF2	Q02208	771 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	ARP10	Q04549	284 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	COQ9	Q05779	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	FRE7	Q12333	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	CBP1	P07252	654 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	CNA1	P23287	553 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	SNO3	P43544	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS31	YLR167W	AIM22	P47051	409 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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