RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	FAM205C	A6NFA0	338 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	MARCH6	O60337	910 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	UBASH3A	P57075	661 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	TCP10	Q12799	353 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	TNFAIP1	Q13829	316 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	TNIP1	Q15025	636 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	LETM2	Q2VYF4	491 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	SLFN13	Q68D06	897 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA20	Q8TB22	786 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	FAM151A	Q8WW52	585 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	PAGE5	Q96GU1	130 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	GMCL1	Q96IK5	515 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	EPSTI1	Q96J88	318 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	CSRNP1	Q96S65	589 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	MXD3	Q9BW11	206 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	GOPC	Q9HD26	462 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	DISC1	Q9NRI5	854 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PNKP-231	ENST00000640501	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		9.4	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SCN9A	Q15858	1988 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	EP400	Q96L91	3159 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	AP5Z1	O43299	807 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	RAD21	O60216	631 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TUBB4A	P04350	444 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TPM2	P07951	284 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TPM1	P09493	284 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SPDYE6	P0CI01	402 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PTGS1	P23219	599 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	AFM	P43652	599 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FANCC	Q00597	558 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	NFIA	Q12857	509 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	AP3B2	Q13367	1082 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CALCRL	Q16602	461 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FAM83A	Q86UY5	434 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TBCK	Q8TEA7	893 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SHISA4	Q96DD7	197 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	HOOK2	Q96ED9	719 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	AMN	Q9BXJ7	453 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	GINM1	Q9NU53	330 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	IFNK	Q9P0W0	207 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	STK17A	Q9UEE5	414 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TBC1D12	O60347	775 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KCNJ6	P48051	423 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	GRIN1	Q05586	938 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	DPYD	Q12882	1025 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PDIA5	Q14554	519 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KCNB1	Q14721	858 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA1	Q5VX52	437 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ISM2	Q6H9L7	571 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CABP7	Q86V35	215 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PNMA2	Q9UL42	364 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	BICDL2	A1A5D9	508 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91

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