RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SNAP25P60880 206 aa9.88□□□□□ -0.83
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SGMS1-211ENST00000626236 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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SGMS1-211ENST00000626236 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.88□□□□□ -0.83
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SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.84□□□□□ -0.83
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SGMS1-211ENST00000626236 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
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