RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 IQCA1Q86XH1 822 aa34.1■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa34.09■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC34A2O95436 690 aa34.09■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 TKFCQ3LXA3 575 aa34.09■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 TRERF1Q96PN7 1200 aa34.09■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 IL25Q9H293 177 aa34.09■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF536O15090 1300 aa34.08■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 B4E1Z4 1266 aa34.08■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 RARBP10826 455 aa34.08■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 SYDE2Q5VT97 1194 aa34.08■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 CCPG1Q9ULG6 757 aa34.08■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 RAD50Q92878 1312 aa34.07■■■■□ 3.05
SEMA3B-215ENST00000621029 POTEB2H3BUK9 544 aa34.07■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 CHMLP26374 656 aa34.07■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 NT5C2P49902 561 aa34.07■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC26Q2I0M4 334 aa34.07■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC178Q5BJE1 867 aa34.07■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 PDHBP11177 359 aa34.06■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 SYN1P17600 705 aa34.06■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP34.06■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 DGKHQ86XP1 1220 aa34.06■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT23Q9C075 422 aa34.06■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa34.06■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa34.05■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 AKR1A1P14550 325 aa34.05■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 KAT14Q9H8E8 782 aa34.05■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 CNNM2Q9H8M5 875 aa34.05■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 CNTN2Q02246 1040 aa34.04■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa34.04■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 BTNL9Q6UXG8 535 aa34.04■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa34.03■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 FRMPD3Q5JV73 1810 aa34.03■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ICAM1P05362 532 aa34.03■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF543Q08ER8 600 aa34.03■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 ZSWIM5Q9P217 1185 aa34.03■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM184BQ9ULE4 1060 aa34.03■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC41Q15345 812 aa34.02■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 NSMFQ6X4W1 530 aa34.02■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 UBAC1Q9BSL1 405 aa34.02■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
SEMA3B-215ENST00000621029 PGK1P00558 417 aa34.01■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 MUM1L1Q5H9M0 696 aa34.01■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF180Q86T96 592 aa34.01■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 PNMA1Q8ND90 353 aa34.01■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ALPK3Q96L96 1907 aa34■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 GOLGA8HP0CJ92 632 aa34■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ADCYAP1R1P41586 468 aa34■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ACVR2BQ13705 512 aa34■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ARMCX2Q7L311 632 aa34■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 FERMT2Q96AC1 680 aa34■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 TRDNQ13061 729 aa33.99■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa33.99■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 FGD4Q96M96 766 aa33.99■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 LAMA4Q16363 1823 aa33.99■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 TNKSO95271 1327 aa33.99■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 SNHG28P0DPA3 235 aa33.98■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 PTH1RQ03431 593 aa33.98■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM133AQ8N9E0 248 aa33.98■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa33.98■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 CYP39A1Q9NYL5 469 aa33.97■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa33.97■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 SOWAHBA6NEL2 793 aa33.96■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 RTP1P59025 263 aa33.96■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 UBA5Q9GZZ9 404 aa33.96■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 PNMA2Q9UL42 364 aa33.96■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ASB14A6NK59 587 aa33.95■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 SGSM2O43147 1006 aa33.95■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP33.95■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa33.95■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKS1AQ92625 1134 aa33.95■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa33.95■■■■□ 3.03
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC144BQ3MJ40 725 aa33.94■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 PRO3102Q9H379 93 aa33.94■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 CPVLQ9H3G5 476 aa33.94■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa33.94■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 PTPDC1A2A3K4 754 aa33.93■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 NFIBO00712 420 aa33.92■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 CYP21A2P08686 494 aa33.92■■■■□ 3.02
SEMA3B-215ENST00000621029 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms