RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-204ENST00000620385 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-204ENST00000620385 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-204ENST00000620385 XDHP47989 1333 aa9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ERICH2A1L162 156 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CPLX1O14810 134 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CAVIN2O95810 425 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 INHAP05111 366 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TAF1P21675 1872 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 HSPA1LP34931 641 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TDO2P48775 406 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 GSTO1P78417 241 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CRY2Q49AN0 593 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 USP48Q86UV5 1035 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 NECAB1Q8N987 351 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ZIC5Q96T25 663 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 FAM177BA6PVY3 158 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 EFSO43281 561 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 APPP05067 770 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 GDF10P55107 478 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 RESTQ13127 1097 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 HS1BP3Q53T59 392 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 SPATA32Q96LK8 384 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 MARK1Q9P0L2 795 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 FIBPO43427 364 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CALM1P0DP23 149 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CALM2P0DP24 149 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CALM3P0DP25 149 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ALAS2P22557 587 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 SMTNP53814 917 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 APOBRQ0VD83 1088 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 STK3Q13188 491 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 UVSSAQ2YD98 709 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 APOA5Q6Q788 366 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 SYT9Q86SS6 491 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ESR2Q92731 530 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TSPY26PQ9H489 355 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 MYH6P13533 1939 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 M0R082 166 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 PLSCR1O15162 318 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CTAGE5O15320 804 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ZBTB43O43298 467 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 YEATS4O95619 227 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CHGBP05060 677 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CYP7A1P22680 504 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ANTXR2P58335 489 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 LRP8Q14114 963 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 GRIK4Q16099 956 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-204ENST00000620385 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms