RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.18■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.18■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.18■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 MYH6P13533 1939 aa29.18■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 SLC16A2P36021 539 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 TKFCQ3LXA3 575 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 PGK2P07205 417 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 CYP2C19P33261 490 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 SLC4A3P48751 1232 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 AGBL1Q96MI9 1066 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 MCM3APO60318 1980 aa29.16■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.16■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 NECTIN1Q15223 517 aa29.16■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 CCDC174Q6PII3 467 aa29.15■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 DDX11Q96FC9 970 aa29.15■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 ACAD9Q9H845 621 aa29.15■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 CEP290O15078 2479 aa29.14■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 ICAM1P05362 532 aa29.14■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 CYBAP13498 195 aa29.14■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 SNAP25P60880 206 aa29.14■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.14■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 RNF146Q9NTX7 359 aa29.14■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.14■■■□□ 2.26
PMS1-220ENST00000618056 SLC27A2O14975 620 aa29.13■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29.13■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.13■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.13■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA8HP0CJ92 632 aa29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 LHX8Q68G74 356 aa29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 TRPV1Q8NER1 839 aa29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 TINF2Q9BSI4 451 aa29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 PNMA2Q9UL42 364 aa29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.12■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 ERICH2A1L162 156 aa29.11■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 ALAS1P13196 640 aa29.11■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.11■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 MSCO60682 206 aa29.1■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 MTA3Q9BTC8 594 aa29.1■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.1■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 LCTP09848 1927 aa29.1■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 ANTXR2P58335 489 aa29.1■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.1■■■□□ 2.25
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PMS1-220ENST00000618056 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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PMS1-220ENST00000618056 CHST3Q7LGC8 479 aa29.08■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.08■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.08■■■□□ 2.25
PMS1-220ENST00000618056 CNGA1P29973 690 aa29.07■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 FGD4Q96M96 766 aa29.07■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 CPVLQ9H3G5 476 aa29.07■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 SEPT4O43236 478 aa29.06■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 MCM5P33992 734 aa29.06■■■□□ 2.24
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PMS1-220ENST00000618056 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.06■■■□□ 2.24
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PMS1-220ENST00000618056 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.05■■■□□ 2.24
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PMS1-220ENST00000618056 PRC1O43663 620 aa29.04■■■□□ 2.24
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PMS1-220ENST00000618056 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.04■■■□□ 2.24
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PMS1-220ENST00000618056 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 GRM4Q14833 912 aa29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 HTATIP2Q9BUP3 242 aa29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 LY9Q9HBG7 655 aa29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 CNPY2Q9Y2B0 182 aa29.04■■■□□ 2.24
PMS1-220ENST00000618056 KLRF2D3W0D1 207 aa29.03■■■□□ 2.24
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