RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-223	ENST00000589266	LARGE1	O95461	756 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	SMARCA1	P28370	1054 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC1A4	P43007	532 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF543	Q08ER8	600 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	CUL4A	Q13619	759 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	PTPRF	P10586	1907 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	SCRN1	Q12765	414 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	COA7	Q96BR5	231 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	PLA2G6	O60733	806 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	BMP3	P12645	472 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	STK3	Q13188	491 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	RXRA	P19793	462 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	BMP8B	P34820	402 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	HMGCS2	P54868	508 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	GPR153	Q6NV75	609 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	CDKL5	O76039	1030 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	CDC27	P30260	824 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC96	Q2M329	555 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	NECAB1	Q8N987	351 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	GDF15	Q99988	308 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	MTMR7	Q9Y216	660 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	ALPK3	Q96L96	1907 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	CPLX1	O14810	134 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	RAD21	O60216	631 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	VCAM1	P19320	739 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CIRBP-223	ENST00000589266	KLRF2	D3W0D1	207 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	IFNAR1	P17181	557 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	ST3GAL1	Q11201	340 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	NTRK3	Q16288	839 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24	6e-8	■■□□□ 14.4
CIRBP-223	ENST00000589266	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	FEM1B	Q9UK73	627 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM160B2	Q86V87	743 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	KCTD1	Q719H9	257 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	DEFB123	Q8N688	67 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	PNMA3	Q9UL41	463 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L15	C9J2P7	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L11	C9JVI0	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L18	D6R9N7	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L22	D6RA61	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L19	D6RCP7	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L20	D6RJB6	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	STAT2	P52630	851 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L24	Q0WX57	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	FUT2	Q10981	343 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	TMEM232	C9JQI7	657 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	STK36	Q9NRP7	1315 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-223	ENST00000589266	CTDNEP1	O95476	244 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CIRBP-223	ENST00000589266	HMGCR	P04035	888 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CIRBP-223	ENST00000589266	FDX1	P10109	184 aa		29.01	■■■□□ 2.23

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