RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 CYP2C19P33261 490 aa22.33■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 SEC23AQ15436 765 aa22.33■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.33■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.33■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 ERICH2A1L162 156 aa22.32■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 NECTIN1Q15223 517 aa22.32■■□□□ 1.16
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PKD1-232ENST00000566905 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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PKD1-232ENST00000566905 MAML3Q96JK9 1138 aa22.31■■□□□ 1.16
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PKD1-232ENST00000566905 RNF146Q9NTX7 359 aa22.31■■□□□ 1.16
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PKD1-232ENST00000566905 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.3■■□□□ 1.16
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PKD1-232ENST00000566905 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.3■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 ACAD9Q9H845 621 aa22.3■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 MCM3APO60318 1980 aa22.29■■□□□ 1.16
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PKD1-232ENST00000566905 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.29■■□□□ 1.16
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PKD1-232ENST00000566905 RNF20Q5VTR2 975 aa22.29■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 SENP2Q9HC62 589 aa22.29■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 ICAM1P05362 532 aa22.28■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 TKFCQ3LXA3 575 aa22.28■■□□□ 1.16
PKD1-232ENST00000566905 PRC1O43663 620 aa22.27■■□□□ 1.16
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PKD1-232ENST00000566905 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.26■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 MCM5P33992 734 aa22.26■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.26■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.26■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.25■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.25■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 RASEFQ8IZ41 740 aa22.23■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.23■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 LY9Q9HBG7 655 aa22.23■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 NEK1Q96PY6 1258 aa22.22■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 TROAPQ12815 778 aa22.21■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.21■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 FGD4Q96M96 766 aa22.21■■□□□ 1.15
PKD1-232ENST00000566905 MTA3Q9BTC8 594 aa22.21■■□□□ 1.15
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