RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 MAML3Q96JK9 1138 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 FBXO40Q9UH90 709 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ZNF536O15090 1300 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 CHST13Q8NET6 341 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 RNF146Q9NTX7 359 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 SNHG28P0DPA3 235 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 CPVLQ9H3G5 476 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 ACAD9Q9H845 621 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 ERICH2A1L162 156 aa22.13■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 SLC27A2O14975 620 aa22.13■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 TRPV1Q8NER1 839 aa22.13■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.13■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 ICAM1P05362 532 aa22.12■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 TKFCQ3LXA3 575 aa22.12■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.12■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 CYBAP13498 195 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 TINF2Q9BSI4 451 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 IGHA2P01877 340 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 ANTXR2P58335 489 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 WTAPQ15007 396 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 NECTIN1Q15223 517 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 NSMFQ6X4W1 530 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 POTEB2H3BUK9 544 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 CNTN2Q02246 1040 aa22.09■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 PRC1O43663 620 aa22.08■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 RNF20Q5VTR2 975 aa22.08■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.08■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.08■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 DPF3Q92784 378 aa22.08■■□□□ 1.13
USP10-208ENST00000563386 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.08■■□□□ 1.13
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USP10-208ENST00000563386 USH1GQ495M9 461 aa22.07■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.07■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.07■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 PFASO15067 1338 aa22.06■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 KLRF2D3W0D1 207 aa22.06■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 MCM5P33992 734 aa22.06■■□□□ 1.12
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USP10-208ENST00000563386 SEPT4O43236 478 aa22.05■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 MSCO60682 206 aa22.05■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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USP10-208ENST00000563386 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.05■■□□□ 1.12
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USP10-208ENST00000563386 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.04■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 PNMA2Q9UL42 364 aa22.04■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.04■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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