RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOX10P56693 466 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.89■■□□□ 1.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDAH1O94760 285 aa25.88■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LIFRP42702 1097 aa25.88■■□□□ 1.73
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRM4Q14833 912 aa25.88■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTFR1Q15390 333 aa25.88■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.88■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF146Q9NTX7 359 aa25.88■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.88■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COBLO75128 1261 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP26Q9BXU7 913 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACAD9Q9H845 621 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.87■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC69A6NI79 296 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALAS1P13196 640 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCL5P13501 91 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K14Q99558 947 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPVLQ9H3G5 476 aa25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLRF2D3W0D1 207 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX11Q96FC9 970 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM32Q13049 653 aa25.84■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.84■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.84■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF208Q9H0X6 261 aa25.84■■□□□ 1.73
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.84■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.84■■□□□ 1.73
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMA5P28066 241 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF5BP33176 963 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAML3Q96JK9 1138 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPTORQ8N122 1335 aa25.83■■□□□ 1.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POTEFA5A3E0 1075 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGHA2P01877 340 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GJB1P08034 283 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CALM1P0DP23 149 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CALM2P0DP24 149 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CALM3P0DP25 149 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.725e-7■■□□□ 13.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.82■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PFASO15067 1338 aa25.82■■□□□ 1.72
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.81■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYL10Q9BUA6 226 aa25.81■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.8■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTMR8Q96EF0 704 aa25.8■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.8■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYH6P13533 1939 aa25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP2C19P33261 490 aa25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGS19P49795 217 aa25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNAQP50148 359 aa25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CAPN2P17655 700 aa25.78■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS6KB1P23443 525 aa25.78■■□□□ 1.72
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