RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.04■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.04■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.04■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.04■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAG1P15918 1043 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNA10Q16322 511 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FSD1Q9BTV5 496 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPARAQ07869 468 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAAP100Q0VG06 881 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPC25Q9HBM1 224 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM232C9JQI7 657 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CST5P28325 142 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM160B2Q86V87 743 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GMCL1Q96IK5 515 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGD4Q96M96 766 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELP1O95163 1332 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAT2P52630 851 aa23■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUCB1Q02818 461 aa23■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLA2G6O60733 806 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC1A4P43007 532 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPHB4P54760 987 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GJA9P57773 515 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FPGSQ05932 587 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARMCX2Q7L311 632 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LNPKQ9C0E8 428 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACAD9Q9H845 621 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYH4Q9Y623 1939 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYADML2A6NDP7 307 aa22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCCP23508 829 aa22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TKFCQ3LXA3 575 aa22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.98■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMP1P01033 207 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASGR1P07306 291 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDK7P50613 346 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDE1AP54750 535 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNTN2Q02246 1040 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNASQ5JWF2 1037 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KATNBL1Q9H079 304 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STX8Q9UNK0 236 aa22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSPY2A6NKD2 308 aa22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADCY6O43306 1168 aa22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKX3-2P78367 333 aa22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EVI5LQ96CN4 794 aa22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF146Q9NTX7 359 aa22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBX21Q9UL17 535 aa22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF536O15090 1300 aa22.96■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EYSQ5T1H1 3165 aa22.95■■□□□ 1.27
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.95■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASB14A6NK59 587 aa22.95■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.95■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.95■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.95■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.94■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARVCFO00192 962 aa22.94■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXP2O15409 715 aa22.94■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.94■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MFSD5Q6N075 450 aa22.94■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.94■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INCENPQ9NQS7 918 aa22.94■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALAS1P13196 640 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOVP48745 357 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNFAIP2Q03169 654 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCTD1Q719H9 257 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TICAM2Q86XR7 235 aa22.93■■□□□ 1.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms