RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	ICAM1	P05362	532 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	LIFR	P42702	1097 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	33.16	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIB2	Q92519	343 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	RIPK3	Q9Y572	518 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF536	O15090	1300 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC69	A6NI79	296 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	ACAD9	Q9H845	621 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	DDAH1	O94760	285 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	SNAP25	P60880	206 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	GRM4	Q14833	912 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	SENP2	Q9HC62	589 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF146	Q9NTX7	359 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PCNX1-206	ENST00000554292	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	ALAS1	P13196	640 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	TROAP	Q12815	778 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	DDX11	Q96FC9	970 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	MAP3K14	Q99558	947 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	USP26	Q9BXU7	913 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	KLRF2	D3W0D1	207 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	PSMA5	P28066	241 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	SOX10	P56693	466 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CALM1	P0DP23	149 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CALM2	P0DP24	149 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CALM3	P0DP25	149 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CCL5	P13501	91 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CCL14	Q16627	93 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	COBL	O75128	1261 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	KIF5B	P33176	963 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	MTFR1	Q15390	333 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF208	Q9H0X6	261 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CPVL	Q9H3G5	476 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	PFAS	O15067	1338 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	FGD1	P98174	961 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	CENPF	P49454	3210 aa		33.07	■■■□□ 2.89
PCNX1-206	ENST00000554292	RPTOR	Q8N122	1335 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	PGK2	P07205	417 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	MAML3	Q96JK9	1138 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	GJB1	P08034	283 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	GNAQ	P50148	359 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	33.05	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM32	Q13049	653 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	MYL10	Q9BUA6	226 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	CAPN2	P17655	700 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	TRAF1	Q13077	416 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	ABCB11	O95342	1321 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	POTEF	A5A3E0	1075 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	POTEB2	H3BUK9	544 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PCNX1-206	ENST00000554292	RPS6KB1	P23443	525 aa		33.02	■■■□□ 2.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms