RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	MTA3	Q9BTC8	594 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TPCN1-222	ENST00000552897	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
TPCN1-222	ENST00000552897	POTEF	A5A3E0	1075 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TPCN1-222	ENST00000552897	PGK2	P07205	417 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TPCN1-222	ENST00000552897	COPB2	P35606	906 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TPCN1-222	ENST00000552897	TROAP	Q12815	778 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TPCN1-222	ENST00000552897	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TPCN1-222	ENST00000552897	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TPCN1-222	ENST00000552897	IGHA2	P01877	340 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	HMGCR	P04035	888 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	CPA1	P15085	419 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	GRM4	Q14833	912 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	DPP9	Q86TI2	863 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM87B	Q96K49	555 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		28.26	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	CCL5	P13501	91 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	ICAM1	P05362	532 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	ALAS1	P13196	640 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	UBXN2A	P68543	259 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	KRT32	Q14532	448 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	CHST13	Q8NET6	341 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	RNF146	Q9NTX7	359 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	LIFR	P42702	1097 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	KCTD2	Q14681	263 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	KLRF2	D3W0D1	207 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	BRCA2	P51587	3418 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	TKFC	Q3LXA3	575 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	RNF208	Q9H0X6	261 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	ACAD9	Q9H845	621 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	FBXO40	Q9UH90	709 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		28.2	■■■□□ 2.11
TPCN1-222	ENST00000552897	SEC24B	O95487	1268 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	CYP2C19	P33261	490 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	MAML3	Q96JK9	1138 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	RXRA	P19793	462 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	TMTC2	Q8N394	836 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	DDX11	Q96FC9	970 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	FGD4	Q96M96	766 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC69	A6NI79	296 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	CYTH3	O43739	400 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	DDAH1	O94760	285 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	MTMR8	Q96EF0	704 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	RGS19	P49795	217 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	TRPV1	Q8NER1	839 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	RPTOR	Q8N122	1335 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	NFIB	O00712	420 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	GJB1	P08034	283 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	CNTN2	Q02246	1040 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
TPCN1-222	ENST00000552897	RPS6KB1	P23443	525 aa		28.15	■■■□□ 2.1

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