RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 GNASQ5JWF2 1037 aa8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ZBTB33Q86T24 672 aa8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 SPC25Q9HBM1 224 aa8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 KIF16BQ96L93 1317 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 H3BNC9 293 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 CASP7P55210 303 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 HYAL1Q12794 435 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ITGA7Q13683 1181 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 GCKRQ14397 625 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 CRBNQ96SW2 442 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 COL4A3Q01955 1670 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 FRYQ5TBA9 3013 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.8□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ASNSP08243 561 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ERCC3P19447 782 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 GJA9P57773 515 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 FLIIQ13045 1269 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ADAM15Q13444 863 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 GPM6BQ13491 265 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 EPC2Q52LR7 807 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 G2E3Q7L622 706 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 SAMD11Q96NU1 681 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 SIL1Q9H173 461 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 MROH8Q9H579 483 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 SCN5AQ14524 2016 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 PTPRSQ13332 1948 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 GRIN2DO15399 1336 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.79□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 CABYRO75952 493 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 C1QTNF9P0C862 333 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 AOC1P19801 751 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 LINS1Q8NG48 757 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 NCDNQ9UBB6 729 aa8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-225ENST00000551253 MYO7AQ13402 2215 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 SLC30A4O14863 429 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 PI15O43692 258 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 IQCF3P0C7M6 154 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 NKX3-2P78367 333 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 COASYQ13057 564 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 MTMR3Q13615 1198 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 KIF12Q96FN5 646 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 C12orf42Q96LP6 360 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 INCENPQ9NQS7 918 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 INSL6Q9Y581 213 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 LINC01565O15544 149 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 BRD1O95696 1058 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 FCER1AP12319 257 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 NDUFV1P49821 464 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 DEFB103AP81534 67 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 PICALMQ13492 652 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-225ENST00000551253 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
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