RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 OLFML2BQ68BL8 750 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 CHST3Q7LGC8 479 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 ANO2Q9NQ90 1003 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 RNF146Q9NTX7 359 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 CYBAP13498 195 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 OAZ1P54368 228 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRU-211ENST00000531385 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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PTPRU-211ENST00000531385 FDX1P10109 184 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRU-211ENST00000531385 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRU-211ENST00000531385 ANKS1AQ92625 1134 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRU-211ENST00000531385 ACAD9Q9H845 621 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRU-211ENST00000531385 SLC27A2O14975 620 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 ANTXR2P58335 489 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 NCOA7Q8NI08 942 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-211ENST00000531385 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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PTPRU-211ENST00000531385 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
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PTPRU-211ENST00000531385 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-211ENST00000531385 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.94■■□□□ 1.1
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PTPRU-211ENST00000531385 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRU-211ENST00000531385 NSMFQ6X4W1 530 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-211ENST00000531385 ASTN1O14525 1302 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRU-211ENST00000531385 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 MYL10Q9BUA6 226 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRU-211ENST00000531385 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.89■■□□□ 1.09
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