RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 FGD4Q96M96 766 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC14Q96N46 770 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT23Q9C075 422 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 NEFLP07196 543 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.97■■□□□ 1.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 DGKHQ86XP1 1220 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF146Q9NTX7 359 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 E7EWF7 191 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC23AQ15436 765 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 ANO1Q5XXA6 986 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-218ENST00000511185 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 CNGA1P29973 690 aa21.95■■□□□ 1.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 ACAD9Q9H845 621 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 KAT14Q9H8E8 782 aa21.95■■□□□ 1.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 CHST13Q8NET6 341 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 PFASO15067 1338 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 ICAM1P05362 532 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 NT5C2P49902 561 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.93■■□□□ 1.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 TINF2Q9BSI4 451 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTN2Q02246 1040 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 DDX11Q96FC9 970 aa21.92■■□□□ 1.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.9■■□□□ 1.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPT4O43236 478 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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SH3BP2-218ENST00000511185 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 ADCY6O43306 1168 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 COL6A1P12109 1028 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 NECTIN1Q15223 517 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.88■■□□□ 1.09
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SH3BP2-218ENST00000511185 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 USH1GQ495M9 461 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMCX2Q7L311 632 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.87■■□□□ 1.09
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