RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491749.2

EFHC1-204, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-204	ENST00000491749	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		29.1	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	MYH6	P13533	1939 aa		29.1	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	ICAM1	P05362	532 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	TKFC	Q3LXA3	575 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	TMEM87B	Q96K49	555 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	GJB1	P08034	283 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	KRT32	Q14532	448 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	ACAD9	Q9H845	621 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	SENP2	Q9HC62	589 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	RNF146	Q9NTX7	359 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	RPTOR	Q8N122	1335 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EFHC1-204	ENST00000491749	PGK2	P07205	417 aa		29.07	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	RASEF	Q8IZ41	740 aa		29.07	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24	3e-6	■□□□□ 8.9
EFHC1-204	ENST00000491749	LY9	Q9HBG7	655 aa		29.07	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	PNMA2	Q9UL42	364 aa		29.07	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	ALAS1	P13196	640 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	HSPA4	P34932	840 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	DDX11	Q96FC9	970 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	NEK1	Q96PY6	1258 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	GJA8	P48165	433 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	KCNB2	Q92953	911 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	MAML3	Q96JK9	1138 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	CPVL	Q9H3G5	476 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	IGHA2	P01877	340 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	GRM4	Q14833	912 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	TMTC2	Q8N394	836 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	TROAP	Q12815	778 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	DEFB118	Q96PH6	123 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	KLRF2	D3W0D1	207 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	CYP2C19	P33261	490 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	LIFR	P42702	1097 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EFHC1-204	ENST00000491749	PFAS	O15067	1338 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	DDAH1	O94760	285 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	SGPL1	O95470	568 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	SHISA4	Q96DD7	197 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	CCDC69	A6NI79	296 aa		29	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	CAPN2	P17655	700 aa		29	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	MAP3K14	Q99558	947 aa		29	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		29	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		28.99	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		28.99	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		28.99	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	LCT	P09848	1927 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	CYBA	P13498	195 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	TINF2	Q9BSI4	451 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	MCM3AP	O60318	1980 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	POTEB2	H3BUK9	544 aa		28.97	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	KIF5B	P33176	963 aa		28.97	■■■□□ 2.23
EFHC1-204	ENST00000491749	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23

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