RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FERMT2Q96AC1 680 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC17Q96LX7 622 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GMLQ99445 158 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PSMD1Q99460 953 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 EHD4Q9H223 541 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ZNRF3Q9ULT6 936 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 BCS1LQ9Y276 419 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MAST2Q6P0Q8 1798 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 A0A1W2PRG0 241 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 F5H6K3 240 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SLFN14P0C7P3 912 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PTGS1P23219 599 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GNA11P29992 359 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TRAPPC10P48553 1259 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ICA1Q05084 483 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 KLRC3Q07444 240 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 LRMPQ12912 555 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MMRN1Q13201 1228 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ARID5BQ14865 1188 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ABCB5Q2M3G0 1257 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SOGA3Q5TF21 947 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TBCKQ8TEA7 893 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 C6orf50Q9HD87 102 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 LAMB1P07942 1786 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 COL4A5P29400 1685 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L15C9J2P7 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L11C9JVI0 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L18D6R9N7 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L22D6RA61 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L19D6RCP7 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L20D6RJB6 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 WNT10BO00744 389 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SOCS7O14512 581 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ECE1P42892 770 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ZNF75DP51815 510 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NLRP12P59046 1061 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L24Q0WX57 530 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 IKQ13123 557 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NCAPHQ15003 741 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 UBE2SQ16763 222 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PTPN21Q16825 1174 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NIM1KQ8IY84 436 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 JDP2Q8WYK2 163 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GJA10Q969M2 543 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MTRQ99707 1265 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FANCLQ9NW38 375 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NAV1Q8NEY1 1877 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NFKBIEO00221 500 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 COBLO75128 1261 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ENTPD3O75355 529 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 BMP15O95972 392 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 POLD1P28340 1107 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SMARCA1P28370 1054 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SLFN13Q68D06 897 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GALNT17Q6IS24 598 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 KLHL10Q6JEL2 608 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 IQUBQ8NA54 791 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ACER1Q8TDN7 264 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SMARCE1Q969G3 411 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PAGE5Q96GU1 130 aa4.68□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MS4A3Q96HJ5 214 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms