RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 NID2Q14112 1375 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 ANO1Q5XXA6 986 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CCDC102AQ96A19 550 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 DESI2Q9BSY9 194 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 STX8Q9UNK0 236 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 STK36Q9NRP7 1315 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 DEXIO95424 95 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TSPY3P0CV98 308 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TSPY8P0CW00 308 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PKN1Q16512 942 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CEP89Q96ST8 783 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MED4Q9NPJ6 270 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 FAM205CA6NFA0 338 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PHACTR2O75167 634 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 MMP1P03956 469 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 GAKO14976 1311 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RASA1P20936 1047 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CACNB3P54284 484 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CLIC6Q96NY7 704 aa15.64■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 VSNL1P62760 191 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 TUBB2AQ13885 445 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SPECC1Q5M775 1068 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 GBP3Q9H0R5 595 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CCDC175P0C221 793 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CDK8P49336 464 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 AOC3Q16853 763 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CPVLQ9H3G5 476 aa15.63■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 C21orf2O43822 256 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SYKP43405 635 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PNMA1Q8ND90 353 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 KAT14Q9H8E8 782 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SLX4Q8IY92 1834 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ADAMTS3O15072 1205 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 WASF1Q92558 559 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ACBD3Q9H3P7 528 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 LAMB1P07942 1786 aa15.62■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 TUBBP07437 444 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 NFIAQ12857 509 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PNOCQ13519 176 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 MTF1Q14872 753 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 MAP3K14Q99558 947 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 DDAH1O94760 285 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RCAN1P53805 252 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 EYA3Q99504 573 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 USP40Q9NVE5 1235 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 HPSEQ9Y251 543 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 KIF5CO60282 957 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SLF2Q8IX21 1173 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 FAM107BQ9H098 131 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CXorf56Q9H5V9 222 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CABP5Q9NP86 173 aa15.61■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ECE2O60344 883 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PLCG2P16885 1265 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 SLC39A14Q15043 492 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 PTPAQ15257 358 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 STYK1Q6J9G0 422 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 CLGNO14967 610 aa15.6■□□□□ 0.09
GPC1-208ENST00000469694 RNF40O75150 1001 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms