RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 SGSM2O43147 1006 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 EVI5O60447 810 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNF146Q9NTX7 359 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 MCM3APO60318 1980 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNM1LO00429 736 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF543Q08ER8 600 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC174Q6PII3 467 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKS1AQ92625 1134 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCTP09848 1927 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNKSO95271 1327 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ICAM1P05362 532 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC16A2P36021 539 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTH1RQ03431 593 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNMA1Q8ND90 353 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 FGD4Q96M96 766 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 KAT14Q9H8E8 782 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNMA2Q9UL42 364 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP21A2P08686 494 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALAS1P13196 640 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNAP25P60880 206 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 AKR1A1P14550 325 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRDNQ13061 729 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 RARBP10826 455 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANO1Q5XXA6 986 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.08■■□□□ 1.13
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KBTBD13C9JR72 458 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 POTEB2H3BUK9 544 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP4K1Q92918 833 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEC23AQ15436 765 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARMCX2Q7L311 632 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNTN2Q02246 1040 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC41Q15345 812 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.06■■□□□ 1.12
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 NCOA7Q8NI08 942 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 ASB14A6NK59 587 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 E7EWF7 191 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 NSMFQ6X4W1 530 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNF180Q86T96 592 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 SKAP1Q86WV1 359 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 KATNBL1Q9H079 304 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 ASTN1O14525 1302 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 NFIBO00712 420 aa22.03■■□□□ 1.12
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