RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 SHISA4Q96DD7 197 aa17.28■□□□□ 0.36
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SH3BP1-205ENST00000466097 CEP290O15078 2479 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 USH1GQ495M9 461 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 NFXL1Q6ZNB6 911 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 STAG2Q8N3U4 1231 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM133AQ8N9E0 248 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-205ENST00000466097 NEK1Q96PY6 1258 aa17.18■□□□□ 0.34
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