RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
NPAS1-201ENST00000439365 RNF180Q86T96 592 aa23.08■■□□□ 1.29
NPAS1-201ENST00000439365 ACAD9Q9H845 621 aa23.08■■□□□ 1.29
NPAS1-201ENST00000439365 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 HIP1O00291 1037 aa23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 ALAS1P13196 640 aa23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 BMP8BP34820 402 aa23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 DCAF4Q8WV16 495 aa23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 RNF146Q9NTX7 359 aa23.08■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 SZT2Q5T011 3432 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF213O14771 459 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 PLA2G6O60733 806 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.07■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 POTEB2H3BUK9 544 aa23.06■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.06■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.06■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.06■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF536O15090 1300 aa23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 SLC16A2P36021 539 aa23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TKFCQ3LXA3 575 aa23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 ESR2Q92731 530 aa23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.05■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 NOVP48745 357 aa23.04■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 CNTN2Q02246 1040 aa23.04■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 ACVR2BQ13705 512 aa23.04■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM60Q495X7 471 aa23.04■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.04■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 ARMCX2Q7L311 632 aa23.04■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TDHQ8IZJ6 230 aa23.04■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 NEDD4P46934 1319 aa23.03■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.03■■□□□ 1.28
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NPAS1-201ENST00000439365 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.03■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.03■■□□□ 1.28
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NPAS1-201ENST00000439365 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.02■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 NSMFQ6X4W1 530 aa23.02■■□□□ 1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TTC14Q96N46 770 aa23.02■■□□□ 1.28
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NPAS1-201ENST00000439365 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.01■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 ICAM1P05362 532 aa23.01■■□□□ 1.27
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NPAS1-201ENST00000439365 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.01■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 FGD4Q96M96 766 aa23.01■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 SPC25Q9HBM1 224 aa23.01■■□□□ 1.27
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NPAS1-201ENST00000439365 A0A1W2PQY0 241 aa23■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 PDHBP11177 359 aa23■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 IQCA1Q86XH1 822 aa23■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 FAM133AQ8N9E0 248 aa23■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 ASB14A6NK59 587 aa22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 KDM4AO75164 1064 aa22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 ADAMTS4O75173 837 aa22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 PDE4AP27815 886 aa22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.99■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 SNX17Q15036 470 aa22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 KCNA10Q16322 511 aa22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 TTC22Q5TAA0 569 aa22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.98■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 B4E1Z4 1266 aa22.97■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 ACLYP53396 1101 aa22.97■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 TLE2Q04725 743 aa22.97■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF543Q08ER8 600 aa22.97■■□□□ 1.27
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.97■■□□□ 1.27
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