RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 GNAT2P19087 354 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 PTH1RQ03431 593 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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PRAME-208ENST00000438888 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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PRAME-208ENST00000438888 TSPY3P0CV98 308 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 TSPY8P0CW00 308 aa14.65□□□□□ -0.06
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PRAME-208ENST00000438888 RAG1P15918 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
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PRAME-208ENST00000438888 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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PRAME-208ENST00000438888 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.65□□□□□ -0.06
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PRAME-208ENST00000438888 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-208ENST00000438888 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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PRAME-208ENST00000438888 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 TTLL1O95922 423 aa14.64□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 MAP4K1Q92918 833 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 NAPBQ9H115 298 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 FEM1BQ9UK73 627 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 LAMA4Q16363 1823 aa14.64□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.63□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 ATP2A1O14983 1001 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 KIAA0355O15063 1070 aa14.62□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 MYLIPQ8WY64 445 aa14.62□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 FBXO40Q9UH90 709 aa14.62□□□□□ -0.07
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PRAME-208ENST00000438888 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 FAAP100Q0VG06 881 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 ALX1Q15699 326 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 CCDC174Q6PII3 467 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-208ENST00000438888 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.61□□□□□ -0.07
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