RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 TKFCQ3LXA3 575 aa24.64■■□□□ 1.54
UBXN4-204ENST00000426921 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.64■■□□□ 1.54
UBXN4-204ENST00000426921 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
UBXN4-204ENST00000426921 ACAD9Q9H845 621 aa24.64■■□□□ 1.54
UBXN4-204ENST00000426921 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.64■■□□□ 1.54
UBXN4-204ENST00000426921 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 NUCB1Q02818 461 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 KCTD1Q719H9 257 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 FERMT2Q96AC1 680 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1W2PQY0 241 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 IGHDP01880 384 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 ACVR2BQ13705 512 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 DCAF4Q8WV16 495 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 RNF146Q9NTX7 359 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.62■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.61■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 ARMCX2Q7L311 632 aa24.61■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 KATNBL1Q9H079 304 aa24.61■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.6■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.6■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 MCM3APO60318 1980 aa24.6■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 POTEB2H3BUK9 544 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 ADCY6O43306 1168 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 SDSP20132 328 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 ACLYP53396 1101 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 CNTN2Q02246 1040 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 TLE2Q04725 743 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 RILPL2Q969X0 211 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 COL6A3P12111 3177 aa24.58■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.58■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.58■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.58■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.58■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 TOMM22Q9NS69 142 aa24.58■■□□□ 1.53
UBXN4-204ENST00000426921 LAMA4Q16363 1823 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 ICAM1P05362 532 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 ALAS1P13196 640 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 HAND2P61296 217 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 NKX3-2P78367 333 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC96Q2M329 555 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 MYADML2A6NDP7 307 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 CLTBP09497 229 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 NT5C2P49902 561 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 GJA9P57773 515 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC174Q6PII3 467 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 DEFB123Q8N688 67 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 TTC14Q96N46 770 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 TOX2Q96NM4 488 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 ASTN1O14525 1302 aa24.56■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 ASB14A6NK59 587 aa24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 PDHBP11177 359 aa24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 SNAP25P60880 206 aa24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 KCNA10Q16322 511 aa24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 BADQ92934 168 aa24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
UBXN4-204ENST00000426921 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms