RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa19.52■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa19.52■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHIPQ8WWQ0 1821 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMP1P03956 469 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC10A3P09131 477 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 CALML3P27482 149 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOSBP53539 338 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAPAP54920 295 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 GALNT17Q6IS24 598 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRMS1Q9HCU9 246 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC9Q9Y397 364 aa19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESYT2A0FGR8 921 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 VWA5AO00534 786 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSBPP22059 807 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP5P59047 1200 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 GUCY1B3Q02153 619 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL15Q16663 113 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPAT2Q6NUI2 795 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD23Q86SG2 305 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 GJB4Q9NTQ9 266 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OAZ1P54368 228 aa19.49■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LBX2Q6XYB7 198 aa19.49■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MB21D1Q8N884 522 aa19.49■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATG4CQ96DT6 458 aa19.49■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GLT8D2Q9H1C3 349 aa19.49■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNJ14Q9UNX9 436 aa19.49■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 F13A1P00488 732 aa19.48■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 INHBEP58166 350 aa19.48■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC174Q6PII3 467 aa19.48■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SHISA4Q96DD7 197 aa19.48■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C6orf50Q9HD87 102 aa19.48■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.48■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMCO2A6NFE2 343 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP2A1O14983 1001 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT2P35908 639 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRAPQ7Z569 592 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 BICD2Q8TD16 824 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHA4Q9UN74 947 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRPM7Q96QT4 1865 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF536O15090 1300 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTBD19C9JJ37 291 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 REPS2Q8NFH8 660 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCPG1Q9ULG6 757 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC285556D6RIA3 1793 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCB11O95342 1321 aa19.46■□□□□ 0.71
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ADCY7P51828 1080 aa19.45■□□□□ 0.7
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HERVK_113P62684 666 aa19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 RESTQ13127 1097 aa19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPY5RQ15761 445 aa19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 USH1GQ495M9 461 aa19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 FERMT3Q86UX7 667 aa19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 BLIDQ8IZY5 108 aa19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIC8AQ9NPQ8 531 aa19.45■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASSF10A6NK89 507 aa19.44■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTBD18B2RXH4 712 aa19.44■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 SREBF2Q12772 1141 aa19.44■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOSTRINQ8IVI9 506 aa19.44■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPXCR1Q8N123 301 aa19.44■□□□□ 0.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUL5Q93034 780 aa19.44■□□□□ 0.7
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