RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIPK3Q9Y572 518 aa20.28■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF536O15090 1300 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TKFCQ3LXA3 575 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNB2Q92953 911 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SENP2Q9HC62 589 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNMA2Q9UL42 364 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.27■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC69A6NI79 296 aa20.26■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ICAM1P05362 532 aa20.26■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.26■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.26■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACAD9Q9H845 621 aa20.26■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALAS1P13196 640 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIFRP42702 1097 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRM4Q14833 912 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTFR1Q15390 333 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCL14Q16627 93 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPVLQ9H3G5 476 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF146Q9NTX7 359 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.25■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLRF2D3W0D1 207 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COBLO75128 1261 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDAH1O94760 285 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCL5P13501 91 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TROAPQ12815 778 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX11Q96FC9 970 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP26Q9BXU7 913 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF208Q9H0X6 261 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLXNB2O15031 1838 aa20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGK2P07205 417 aa20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K14Q99558 947 aa20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.23■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALM1P0DP23 149 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALM2P0DP24 149 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALM3P0DP25 149 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSMA5P28066 241 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF5BP33176 963 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM32Q13049 653 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAML3Q96JK9 1138 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGD1P98174 961 aa20.21■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.21■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYL10Q9BUA6 226 aa20.21■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.21■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PFASO15067 1338 aa20.21■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPTORQ8N122 1335 aa20.21■□□□□ 0.83
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.2■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.2■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GJB1P08034 283 aa20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYP2C19P33261 490 aa20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNAQP50148 359 aa20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USH1GQ495M9 461 aa20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 222.1 ms