RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 PDRG1Q9NUG6 133 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RLFQ13129 1914 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ZBTB43O43298 467 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ICAM1P05362 532 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 PTPREP23469 700 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 SMARCA1P28370 1054 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 FLT3LGP49771 235 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 PRKCZQ05513 592 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 TKFCQ3LXA3 575 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 APOA5Q6Q788 366 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 CHST13Q8NET6 341 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 CPVLQ9H3G5 476 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 FBXO40Q9UH90 709 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 GJD2Q9UKL4 321 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 GABRQQ9UN88 632 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RIPK3Q9Y572 518 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF536O15090 1300 aa15.94■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 FCER1AP12319 257 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RXRAP19793 462 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RCAN1P53805 252 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 APOBRQ0VD83 1088 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 MORN1Q5T089 497 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 MICU3Q86XE3 530 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.93■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ALAS1P13196 640 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RGS2P41220 211 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 IRF5Q13568 498 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 KCTD2Q14681 263 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 PPP2R5BQ15173 497 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 MMP19Q99542 508 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 BACH2Q9BYV9 841 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.92■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 CYP2B6P20813 491 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 TRAF1Q13077 416 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 MAP2K5Q13163 448 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 GRB14Q14449 540 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RTN1Q16799 776 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 NBPF11Q86T75 865 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 DPP9Q86TI2 863 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 USP6NLQ92738 828 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 MTMR8Q96EF0 704 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ACAD9Q9H845 621 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RNF146Q9NTX7 359 aa15.91■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 PARP14Q460N5 1801 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ZBTB5O15062 677 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ADCY3O60266 1144 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ADORA2AP29274 412 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 NEK4P51957 841 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 EVCP57679 992 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ANKRD1Q15327 319 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 FBXO11Q86XK2 927 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ANKRD35Q8N283 1001 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 DDX11Q96FC9 970 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.9■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 CYTH3O43739 400 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 GRK4P32298 578 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 HOMER1Q86YM7 354 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 PIGSQ96S52 555 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 AMNQ9BXJ7 453 aa15.89■□□□□ 0.13
VPREB1-202ENST00000403807 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms