RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PKP1Q13835 747 aa7.61□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 JCADQ9P266 1359 aa7.61□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 GNRH1P01148 92 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE6CP51160 858 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 IGSF11Q5DX21 431 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC39CQ8N584 583 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM20AQ96MK3 541 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PHF24Q9UPV7 400 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCC11Q96J66 1382 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 TLDC2A0PJX2 215 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 NCK2O43639 380 aa7.6□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP68Q76N32 757 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MGARPQ8TDB4 240 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MYOM1P52179 1685 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CUL3Q13618 768 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 NFE2L2Q16236 605 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP57Q86XR8 500 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL8AQ96BM9 186 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PIDD1Q9HB75 910 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 LRP6O75581 1613 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 NEMFO60524 1076 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 IL33O95760 270 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 STK11Q15831 433 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MCTP1Q6DN14 999 aa7.6□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 GRM1Q13255 1194 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC41Q15345 812 aa7.59□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 SNX27Q96L92 541 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf37Q96NL8 207 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 STK32BQ9NY57 414 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.59□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 S100A5P33763 92 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC8A3P57103 927 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.59□□□□□ -1.19
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