RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361781.6

SGMS1-202, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 3,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-202ENST00000361781 CCDC25Q86WR0 208 aa15.19■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 SNX29Q8TEQ0 813 aa15.19■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 NCK2O43639 380 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 TRIM58Q8NG06 486 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 INTS13Q9NVM9 706 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 PLS1Q14651 629 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 LLGL1Q15334 1064 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 CCDC93Q567U6 631 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 GBP6Q6ZN66 633 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 NLRP3Q96P20 1036 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 KRT12Q99456 494 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ATG3Q9NT62 314 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.023e-7■■■■□ 23.1
SGMS1-202ENST00000361781 PXDNQ92626 1479 aa15.18■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 IFT20Q8IY31 132 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 PIGBQ92521 554 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 HPSEQ9Y251 543 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ABL1P00519 1130 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 MB21D1Q8N884 522 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 DYNLL2Q96FJ2 89 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 NUP58Q9BVL2 599 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 SMCO2A6NFE2 343 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 KCNK3O14649 394 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.17■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 SMIM22K7EJ46 135 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 IFT88Q13099 833 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.026e-7■■■□□ 17.6
SGMS1-202ENST00000361781 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 MAP3K14Q99558 947 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 NEFHP12036 1026 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 GNA11P29992 359 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 KLK7P49862 253 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 SH2D3CQ8N5H7 860 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 CABS1Q96KC9 395 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 EHD2Q9NZN4 543 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 USP17L8P0C7I0 530 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 DPH5Q9H2P9 285 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 NFU1Q9UMS0 254 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.16■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 PPFIA4O75335 1185 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ERVK-24P63145 666 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 TNNC1P63316 161 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 SALL1Q9NSC2 1324 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 USP17L3A6NCW0 530 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 USP17L4A6NCW7 530 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 PLCG1P19174 1290 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 FBXO3Q9UK99 471 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 CPDO75976 1380 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 KLRF2D3W0D1 207 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 BACH1O14867 736 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.15■□□□□ 0.02
SGMS1-202ENST00000361781 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 NF2P35240 595 aa15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 KRT71Q3SY84 523 aa15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 TMC4Q7Z404 712 aa15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 PAK2Q13177 524 aa15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 SUSD4Q5VX71 490 aa15.14■□□□□ 0.01
SGMS1-202ENST00000361781 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms