RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35F6Q8N357 371 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CLTAP09496 248 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 H2AFZP0C0S5 128 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCO4Q5TGY1 634 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 H2AFVQ71UI9 128 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DEPTORQ8TB45 409 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ST7Q9NRC1 585 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 SESN3P58005 492 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HADHQ16836 314 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM9Q13443 819 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD16Q68DU8 428 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 NXNQ6DKJ4 435 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPC6Q9Y210 931 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 POLD1P28340 1107 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 RASSF7Q02833 373 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 K7ENM7 598 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TOM1O60784 492 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCC1Q9HA90 598 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 VCX3AQ9NNX9 186 aa26.48■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP8B1O43520 1251 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DDAH1O94760 285 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT17Q6IS24 598 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM37O94972 964 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE6AP16499 860 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 EHHADHQ08426 723 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8FQ08AF8 430 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 FGAP02671 866 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRX1Q86UT6 975 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PASKQ96RG2 1323 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HAUS2Q9NVX0 235 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TCIRG1Q13488 830 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 BBOF1Q8ND07 529 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 NOD1Q9Y239 953 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ENC1O14682 589 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGDRQ13258 359 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS6KA2Q15349 733 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 SCYL2Q6P3W7 929 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.46■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 COBLO75128 1261 aa26.45■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 RBL2Q08999 1139 aa26.45■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.45■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 PNMA1Q8ND90 353 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP61Q8NHU2 1237 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC8CQ8TDW0 803 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP6R2O75170 966 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 DMTNQ08495 405 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 TEKT1Q969V4 418 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 Q9H521 79 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPRTO14522 1441 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa26.45■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 NAA35Q5VZE5 725 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 MCTP2Q6DN12 878 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 LIG4P49917 911 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 NACA2Q9H009 215 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 USP40Q9NVE5 1235 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 KSR1Q8IVT5 923 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 CUL4BQ13620 913 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM50Q86XT4 487 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 PLXNC1O60486 1568 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR62O43379 1518 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 YARSP54577 528 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 HAUS1Q96CS2 278 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 RUNDC3BQ96NL0 473 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 KLRF2D3W0D1 207 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC39A14Q15043 492 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC197Q8NCU1 140 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 BFSP1Q12934 665 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP4K1Q92918 833 aa26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms