RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AIFM3Q96NN9 605 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNAQP50148 359 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNAP25P60880 206 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT85P78386 507 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM29Q14134 588 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIFC2Q96AC6 838 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDHXO00330 501 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYTH3O43739 400 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAT2P52630 851 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT40Q6A162 431 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FEM1BQ9UK73 627 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCNTO95613 3336 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP2C8P10632 490 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FIBPO43427 364 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PEX10O60683 326 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFNL1Q8IU54 200 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATG4CQ96DT6 458 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP350Q5VT06 3117 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SREBF2Q12772 1141 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COG2Q14746 738 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRAPQ7Z569 592 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DSG3P32926 999 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TM4SF4P48230 202 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKN1Q16512 942 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATL3Q6DD88 541 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM160B2Q86V87 743 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOMER1Q86YM7 354 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLA2G6O60733 806 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INHBEP58166 350 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.349e-15■■■■■ 28.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIGSQ96S52 555 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MBD3O95983 291 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XBP1P17861 261 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OSBPP22059 807 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFAP45Q9UL16 551 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ELP1O95163 1332 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MMP1P03956 469 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HERVK_113P62684 666 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RLFQ13129 1914 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF28PB7ZC32 967 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VWA5AO00534 786 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC174Q6PII3 467 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMARCA1P28370 1054 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP2K2P36507 400 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPT2Q8TD30 523 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNMA3Q9UL41 463 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCG2P13521 617 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA32Q96LK8 384 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE2HP62256 183 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPXCR1Q8N123 301 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms