RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262395.9

TRAF4-201, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF4, Length 2,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-201ENST00000262395 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 DOCK2Q92608 1830 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 RASSF10A6NK89 507 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 INF2Q27J81 1249 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 EHD2Q9NZN4 543 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 KRT86O43790 486 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CALM1P0DP23 149 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CALM2P0DP24 149 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CALM3P0DP25 149 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CXCR5P32302 372 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 COG1Q8WTW3 980 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 BCORQ6W2J9 1755 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 TSPY2A6NKD2 308 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 UBA7P41226 1012 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 SLC7A5Q01650 507 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 BLIDQ8IZY5 108 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 BTG4Q9NY30 223 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 PSMA7O14818 248 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 DDAH1O94760 285 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 KLRK1P26718 216 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 KRT83P78385 493 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 PACS2Q86VP3 889 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 KLRC4O43908 158 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CCDC96Q2M329 555 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 MAP9Q49MG5 647 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CPVLQ9H3G5 476 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 EXOC1Q9NV70 894 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 COL4A1P02462 1669 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 AGPSO00116 658 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 FCER1AP12319 257 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 POLD4Q9HCU8 107 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF263O14978 683 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 TUBBP07437 444 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 TTI2Q6NXR4 508 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAF4-201ENST00000262395 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 RPS6KA5O75582 802 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 DNM2P50570 870 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 STK4Q13043 487 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 SRGNP10124 158 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 HSPA2P54652 639 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 ATP2B2Q01814 1243 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 PDE4DQ08499 809 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 A0A1W2PQC6 194 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 MOCS3O95396 460 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 TRAPPC10P48553 1259 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 KAT14Q9H8E8 782 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 DNA2P51530 1060 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 KIF5AQ12840 1032 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 THAP9Q9H5L6 903 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF4-201ENST00000262395 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms