RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262315.13

CHTF18-201, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHTF18, Length 3,090 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-201ENST00000262315 FAM151AQ8WW52 585 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 EPSTI1Q96J88 318 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 DNAI1Q9UI46 699 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 CCDC66A2RUB6 948 aa15.08■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 GLTPD2A6NH11 291 aa15.08■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 TIGD1Q96MW7 591 aa15.08■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0.01
CHTF18-201ENST00000262315 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 MMP1P03956 469 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 AKR1B1P15121 316 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 RESP18Q5W5W9 173 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 ZNF174Q15697 407 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 CSRNP2Q9H175 543 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 ORC4O43929 436 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 CDC25AP30304 524 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 EPHX2P34913 555 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 GSDMDP57764 484 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 SYCP1Q15431 976 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 IFNAR1P17181 557 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 DNAJC18Q9H819 358 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 HPSEQ9Y251 543 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 NEMFO60524 1076 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 SHISA4Q96DD7 197 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 DESI2Q9BSY9 194 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 SBF1O95248 1867 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 SHMT1P34896 483 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 LIFRP42702 1097 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 POSTNQ15063 836 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 SULF1Q8IWU6 871 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 EPC1Q9H2F5 836 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 CNTNAP1P78357 1384 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 CUTAO60888 179 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 PPP6R2O75170 966 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 CEP95Q96GE4 821 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 KAT14Q9H8E8 782 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.06■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.05■□□□□ 0
CHTF18-201ENST00000262315 CAPN2P17655 700 aa15.05■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 GABPAQ06546 454 aa15.05■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.05■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 SMARCE1Q969G3 411 aa15.05■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.05■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 SWAP70Q9UH65 585 aa15.05■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 MYH1P12882 1939 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 ADM5C9JUS6 153 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 ADAMTS3O15072 1205 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 NRDCO43847 1150 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 DEXIO95424 95 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 GH2P01242 217 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 FAM83AQ86UY5 434 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 ZNF408Q9H9D4 720 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 A0A087X0B3 334 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 RRAGCQ9HB90 399 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 INTS13Q9NVM9 706 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 NAV1Q8NEY1 1877 aa15.04■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 POTEIP0CG38 1075 aa15.03■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 POTEJP0CG39 1038 aa15.03■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 SEPT2Q15019 361 aa15.03■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.03■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.03■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.03■□□□□ -0
CHTF18-201ENST00000262315 FGRP09769 529 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms