RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PPFIA1Q13136 1202 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.292e-7■■■□□ 17.8
SETX-201ENST00000224140 LGSNQ5TDP6 509 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 OGFRQ9NZT2 677 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 IFNKQ9P0W0 207 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 USP17L3A6NCW0 530 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 USP17L4A6NCW7 530 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SCRN1Q12765 414 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 DCAF4Q8WV16 495 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TMEM51Q9NW97 253 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 DNAI1Q9UI46 699 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 FBXO11Q86XK2 927 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PIGBQ92521 554 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 POLR2MP0CAP2 368 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SLFN14P0C7P3 912 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MUTP22033 750 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 FANCCQ00597 558 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PNMA3Q9UL41 463 aa7.01□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ORC4O43929 436 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CABP7Q86V35 215 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SYNCQ9H7C4 482 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TRAF5O00463 557 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MYH3P11055 1940 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 HOMEZQ8IX15 550 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 APBA3O96018 575 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TTLL7Q6ZT98 887 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SERPINB2P05120 415 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 BIN1O00499 593 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 RASSF2P50749 326 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 USP11P51784 963 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CYP27B1O15528 508 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 STAM2O75886 525 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CCDC122Q5T0U0 273 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MED4Q9NPJ6 270 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MST1RQ04912 1400 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PPIP5K2O43314 1243 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 THAP9Q9H5L6 903 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 USH1CQ9Y6N9 552 aa7□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GAS7O60861 476 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TCHPQ9BT92 498 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GBP6Q6ZN66 633 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TNS2Q63HR2 1409 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SFNP31947 248 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CBX8Q9HC52 389 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PIK3C2AO00443 1686 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 NR1I2O75469 434 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 LMNB1P20700 586 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ICA1Q05084 483 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PTGDRQ13258 359 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms