RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120539.7

Lmo4-201, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo4, Length 1,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mbtps2Q8CHX6 515 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tesk2Q8VCT9 570 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Bloc1s4Q8VED2 215 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Map4k1P70218 827 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Siah1bQ06985 282 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc16a10Q3U9N9 512 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc45a1Q8BIV7 751 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 CgnP59242 1191 aa27.42■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fbxo10Q7TQF2 950 aa27.42■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sbf2E9PXF8 1872 aa27.42■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 C87977A2A958 498 aa27.41■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 U2af2P26369 475 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hip1rQ9JKY5 1068 aa27.41■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa27.4■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccng2O08918 344 aa27.4■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cplx1P63040 134 aa27.4■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ubash3aQ3V3E1 624 aa27.4■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa27.4■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 MyocdQ8VIM5 935 aa27.4■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nedd1P33215 660 aa27.4■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cyp4x1Q6A152 507 aa27.4■■□□□ 1.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gna11P21278 359 aa27.39■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atp11aP98197 1187 aa27.39■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Casc1Q6TDU8 730 aa27.39■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Q8K2W9 541 aa27.39■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tmod4Q9JLH8 345 aa27.39■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa27.38■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgap4B1AUY3 965 aa27.38■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hoxa11P31311 313 aa27.38■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Prkag3Q8BGM7 489 aa27.38■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc142Q8CAI1 738 aa27.38■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cul5Q9D5V5 780 aa27.38■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cmtm5Q9D6G9 156 aa27.38■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tex13cD3YU32 604 aa27.37■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rasa1E9PYG6 1038 aa27.37■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tmem132bF7BAB2 1078 aa27.37■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 SelpQ01102 768 aa27.37■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Foxn1Q61575 648 aa27.37■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 IrgqQ8VIM9 583 aa27.37■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Snap47Q8R570 413 aa27.36■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Prpmp5E9PXN1 296 aa27.36■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Stat3P42227 770 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Havcr2Q8VIM0 281 aa27.36■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Bicd2Q921C5 820 aa27.36■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Meis2P97367 477 aa27.35■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NfibP97863 570 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gjb4Q02738 266 aa27.35■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Jakmip3Q5DTN8 844 aa27.35■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cnga2Q62398 664 aa27.35■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Entpd3Q8BFW6 529 aa27.35■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tnni3kQ5GIG6 834 aa27.34■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc9a1Q61165 820 aa27.34■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa27.34■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pla2g6P97819 807 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Usp17leQ7M764 540 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dcaf8Q8N7N5 591 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ttc8Q8VD72 515 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kctd10Q922M3 315 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 AoahO35298 574 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Aco1P28271 889 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Epha2Q03145 977 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Adam39Q7M762 756 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 R3hcc1Q8BSI6 488 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rtp1Q8C8C1 263 aa27.33■■□□□ 1.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gucy1a2F8VQK3 730 aa27.32■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gjd2O54851 321 aa27.32■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cst8P32766 142 aa27.32■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hoxa13Q62424 386 aa27.32■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tmem60Q8K174 133 aa27.32■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Bhmt2Q91WS4 363 aa27.32■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Skint7A7XV04 395 aa27.31■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pla2g4eQ50L42 875 aa27.31■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Adgra1Q8C4G9 578 aa27.31■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Myo1hQ9D6A1 958 aa27.31■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nudt12Q9DCN1 462 aa27.31■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm10392Q3V3I3 114 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rgl1Q60695 768 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Bag4Q8CI61 457 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Anapc4Q91W96 807 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NenfQ9CQ45 171 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Elp3Q9CZX0 547 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fem1bQ9Z2G0 627 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Adamts19P59509 1210 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 GclcP97494 637 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Stard7Q8R1R3 373 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tspyl4Q8VD63 406 aa27.3■■□□□ 1.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cyp2b10P12791 500 aa27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20 ms