RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040924.7

Ss18-201, Transcript of Protein SSXT, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ss18, Length 3,090 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18-201ENSMUST00000040924 IkbkbO88351 757 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Wnt7aP24383 349 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Nkx2-5P42582 318 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ankrd13dQ6PD24 605 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Stkld1Q80YS9 662 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Sox30Q8CGW4 782 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Sirt2Q8VDQ8 389 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Dctpp1Q9QY93 170 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ric1Q69ZJ7 1422 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 PappaQ8R4K8 1624 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tsr1Q5SWD9 803 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Usp49Q6P9L4 685 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ctdspl2Q8BG15 465 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Epha10Q8BYG9 1007 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Armcx6Q8K3A6 301 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Akr1e2Q9DCT1 301 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Taf4bG5E8Z2 855 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Slc8a1P70414 970 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Wdr44Q6NVE8 915 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Asnsd1Q8BFS9 627 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Clic6Q8BHB9 596 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Olfm5Q8BU90 496 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Vmn1r218Q8R261 298 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Vps16Q920Q4 839 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Klhl40Q9D783 621 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Adarb2Q9JI20 745 aa15.98■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gm5624F6ZZG8 207 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 PrphP15331 475 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Epha2Q03145 977 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Chrna5Q2MKA5 467 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Prl2c1Q5SVL9 228 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tldc1Q8K0P3 455 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 1700018B08RikQ9DA83 213 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Myo1eE9Q634 1107 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gjb4Q02738 266 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tmem232Q5K6N0 675 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 MycbpapQ5SUV2 932 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Alx1Q8C8B0 326 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 WtapQ9ER69 396 aa15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Greb1lB9EJV3 1913 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tcp11Q01755 566 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ttf2Q5NC05 1138 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Arhgap44Q5SSM3 814 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Vps37dQ810I0 261 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Exd1Q8CDF7 570 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Krt84Q99M73 603 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Rabgef1Q9JM13 491 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ube4aE9Q735 1028 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Pla2g4bP0C871 782 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Cep131Q62036 1060 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tubb2aQ7TMM9 445 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 MlphQ91V27 590 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Tubb2bQ9CWF2 445 aa15.96■□□□□ 0.15
Ss18-201ENSMUST00000040924 Lrrn4P59383 733 aa15.96■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Myo6Q64331 1265 aa15.96■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Terb1Q8C0V1 768 aa15.96■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Rexo5D3YW29 759 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Pdrg1P59048 133 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Lrrc43Q3V0L5 667 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ccdc148Q6P5U8 527 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Lrrc15Q80X72 579 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Vps53Q8CCB4 832 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Phldb2Q8K1N2 1249 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Xrcc4Q924T3 326 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Eps8l2Q99K30 729 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Prr16A3KMN5 304 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ptpn12P35831 775 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Ccp110Q7TSH4 1004 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Rufy1Q8BIJ7 712 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa15.95■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Myh4Q5SX39 1939 aa15.94■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Eif6O55135 245 aa15.94■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 1810065E05RikQ5NC41 235 aa15.94■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Fermt3Q8K1B8 665 aa15.94■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Erlin1Q91X78 346 aa15.94■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Dhx58Q99J87 678 aa15.94■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Arap2Q8BZ05 1703 aa15.94■□□□□ 0.14
Ss18-201ENSMUST00000040924 Myh7Q91Z83 1935 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.7 ms