RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038913.15

Cnot3-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnot3, Length 2,822 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Cd209bQ8CJ91 325 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Onecut3Q8K557 490 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 AdpgkQ8VDL4 496 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Vps33aQ9D2N9 598 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Galntl5Q9D4M9 431 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Copb1Q9JIF7 953 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Gm5114W4VSN8 858 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ly75Q60767 1723 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Zfp831A2ADM8 1628 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 PpardP35396 440 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ric8aQ3TIR3 530 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Nell2Q61220 819 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ano2Q8CFW1 1002 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Vps18Q8R307 973 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Tmx1Q8VBT0 278 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Mis18aQ9CZJ6 204 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Mfap3lQ9D3X9 409 aa14.72□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Vmn2r71L7N2D8 855 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Gng11P61953 73 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Jdp2P97875 163 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Clca4aQ6Q473 924 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 GlyctkQ8QZY2 523 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Tomm22Q9CPQ3 142 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Abhd2Q9QXM0 425 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Samd1D3YXK1 519 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ugt1a8D3Z748 530 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ugt1a10E9PXN7 530 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Map3k12Q60700 888 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 GnptabQ69ZN6 1235 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Galnt17Q7TT15 598 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Tango6Q8C3S2 1079 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Klhl40Q9D783 621 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Cd274Q9EP73 290 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Cyp2ab1S4R196 498 aa14.71□□□□□ -0.05
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa14.71□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Dnai2A2AC93 623 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Zfand4D3Z3C6 739 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Paxbp1P58501 919 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Gdf10P97737 476 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Kcnb1Q03717 857 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Psg29Q3URN6 468 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Skor1Q8BX46 964 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Alpk1Q9CXB8 1231 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ptf1aQ9QX98 324 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 AmfrQ9R049 643 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Vcam1P29533 739 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Traf1P39428 409 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 WaslQ91YD9 501 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Sap30bpQ02614 308 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Fam196bQ6GQV1 535 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Kctd10Q922M3 315 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Sept14Q9DA97 430 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Prl2c5Q9JLV9 222 aa14.7□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Atp2b4Q6Q477 1205 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Q8C5C9 218 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Tmem63cQ8CBX0 802 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ttll1Q91V51 423 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Fam76aQ922G2 307 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 EhhadhQ9DBM2 718 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 ChmQ9QXG2 665 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ambra1A2AH22 1300 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Fdx1P46656 188 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Uri1Q3TLD5 531 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Oxr1Q4KMM3 866 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ushbp1Q8R370 680 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 MymkQ9D1N4 221 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Inpp4aQ9EPW0 939 aa14.69□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Pola2P33611 600 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Scnn1aQ61180 699 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Igbp1Q61249 340 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Kcnj11Q61743 390 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Trim9Q8C7M3 817 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Cacnb3P54285 484 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Stim1P70302 685 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Asic1Q6NXK8 526 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Ccdc172Q810N9 267 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Klhl10Q9D5V2 608 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Git2Q9JLQ2 708 aa14.68□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Gm5934D3Z4U6 212 aa14.67□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Psmb7P70195 277 aa14.67□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Kctd1Q5M956 257 aa14.67□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Prdm4Q80V63 803 aa14.67□□□□□ -0.06
Cnot3-201ENSMUST00000038913 Prpf40bQ80W14 870 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.4 ms