RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	ERG11	P10614	530 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	KDX1	P36005	433 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RIB5	P38145	238 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	HSE1	P38753	452 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YHR122W	P38829	231 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	UBP9	P39967	754 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	CSN12	P47130	423 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	MIG2	P53035	382 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YPL107W	Q02873	248 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	SNZ1	Q03148	297 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	PEX30	Q06169	523 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RDI1	Q12434	202 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	FOB1	O13329	566 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	SPO11	P23179	398 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	MRX3	P38172	270 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	FMP23	P38231	175 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	POP7	P38291	140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RFC3	P38629	340 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YHR054C	P38780	354 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	GIC1	P38785	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	HAT2	P39984	401 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	APS3	P47064	194 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	MRP51	Q02950	344 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	TRM82	Q03774	444 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YDR239C	Q03780	787 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	AIM36	Q03798	255 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	MCH5	Q08777	521 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	OXR1	Q08952	273 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	NSI1	Q12457	570 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	AI2	P03876	854 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	SEC17	P32602	292 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	TVP38	P36164	337 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	EXO5	P38289	585 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	FET3	P38993	636 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RGI2	P40188	164 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RSM26	P47141	266 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	TWF1	P53250	332 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	NSE5	Q03718	556 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	CRN1	Q06440	651 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YPL257W	Q08974	193 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	TGL5	Q12043	749 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RPN13	O13563	156 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	EXO70	P19658	623 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	SPS22	P25380	463 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	NTH1	P32356	751 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YEL025C	P39991	1188 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	SOK1	P40317	901 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YIR042C	P40586	236 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	HXT9	P40885	567 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YJR054W	P47114	497 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	AIM25	P47140	327 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	PIB2	P53191	635 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	PEX8	P53248	589 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RCF2	P53721	224 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YNG1	Q08465	219 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YRR1	Q12172	810 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RGS2	Q99188	309 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	SAS5	Q99314	248 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	ARE1	P25628	610 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RIM2	P38127	377 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	FLC2	P39719	783 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	INA17	Q02888	182 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	MUB1	Q03162	620 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	YDR248C	Q03786	193 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	IMA2	Q08295	589 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPO31	YOR116C	SKS1	Q12505	502 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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