RNA–Protein interactions for RNA: YJL109C

UTP10, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP10, Length 5,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP10	YJL109C	RXT3	Q07458	294 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PSK2	Q08217	1101 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	THI20	Q08224	551 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	AAD15	Q08361	143 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MET7	Q08645	548 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SWT1	Q12104	458 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TMA17	Q12513	150 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DFG16	Q99234	619 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YLR149C	Q99296	730 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
UTP10	YJL109C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PCK1	P10963	549 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
UTP10	YJL109C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CCA1	P21269	546 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RPB10	P22139	70 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	GID7	P25569	745 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	EMC1	P25574	760 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MET22	P32179	357 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MCM10	P32354	571 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RPD3	P32561	433 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SRB4	P32569	687 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RML2	P32611	393 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PDR3	P33200	976 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	LST4	P34239	828 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	LRG1	P35688	1017 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YKL222C	P35995	705 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YMC2	P38087	329 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	AGP2	P38090	596 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	FLR1	P38124	548 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MMS4	P38257	691 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TSC10	P38342	320 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YHL008C	P38750	627 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YHR054C	P38780	354 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
UTP10	YJL109C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	FHL1	P39521	936 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YJL193W	P39542	402 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MEF2	P39677	819 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SAW1	P39735	261 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ECM10	P39987	644 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	FAU1	P40099	211 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	GAT2	P40209	560 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YJL068C	P40363	299 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ASG1	P40467	964 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SPG5	P42933	373 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	EPL1	P43572	832 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	KEG1	P43614	200 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	IRC18	P47056	224 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YJR096W	P47137	282 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	STE24	P47154	453 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	COS12	P53053	380 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SGF73	P53165	657 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MEP3	P53390	489 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	BET4	Q00618	327 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MRP51	Q02950	344 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SPO19	Q03029	223 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RSN1	Q03516	953 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YMR160W	Q03823	816 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	URC2	Q04411	772 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	FAR10	Q06001	478 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SPH1	Q06160	661 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SKG3	Q06315	1026 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YFT2	Q06676	274 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	IRC3	Q06683	689 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	GUD1	Q07729	489 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	GYP1	Q08484	637 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RAX1	Q08760	435 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TAF10	Q12030	206 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ULA1	Q12059	462 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ATX2	Q12067	313 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ATG29	Q12092	213 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	HUA2	Q12134	243 aa		0.58	□□□□□ -2.32

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