RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MSE1	P48525	536 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MRK1	P50873	501 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	TIM21	P53220	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	TWF1	P53250	332 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YGR111W	P53265	400 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SLI1	P53304	468 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PET117	Q02771	107 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YDC1	Q02896	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NGL3	Q03210	505 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	BCH1	Q05029	724 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PCD1	Q12524	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	KIN28	P06242	306 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	TPK1	P06244	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	GPA2	P10823	449 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	APE1	P14904	514 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RGR1	P19263	1082 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ATP7	P30902	174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	IRE1	P32361	1115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SPT10	P35208	640 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ELF1	P36053	145 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PTC4	P38089	393 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	NPR2	P39923	615 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RGI2	P40188	164 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	EFM4	P40516	257 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	TDA10	P42938	290 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YJR154W	P47181	346 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RTA1	P53047	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YGL204C	P53089	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	DIA1	P54005	336 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	ACS1	Q01574	713 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PEX29	Q03370	554 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RUB1	Q03919	77 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CSI1	Q04368	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	PEX12	Q04370	399 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	SWF1	Q04629	336 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	CRF1	Q04930	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	APM4	Q99186	491 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSC7	YHR039C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	CBS1	P14066	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	TCA17	P32613	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	SPO23	P33757	523 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	GCS1	P35197	352 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	MAL32	P38158	584 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	YBR184W	P38299	523 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	NEM1	P38757	446 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	RPH1	P39956	796 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	RRN7	P40992	514 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	YFH7	P43591	353 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	FMS1	P50264	508 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	YGR053C	P53234	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	MAL12	P53341	584 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	MFM1	Q02783	413 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	GCN5	Q03330	439 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	ULA1	Q12059	462 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	GCN4	P03069	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	RAD18	P10862	487 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	CDC34	P14682	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	HOP1	P20050	605 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	RHB1	P25378	209 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	FUN26	P31381	517 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	SLC1	P33333	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	KKQ8	P36004	724 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	POA1	P38218	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	BZZ1	P38822	633 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	ACO2	P39533	789 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSC7	YHR039C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56 ms